综述分享临床肿瘤中全外显子组测序数据分
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从测序成本和分析需求层面看,目前肿瘤研究中WES是一项性价比较高的成熟技术,越来越多的科研团队采用WES测序方法。一方面需要WES测序及分析的入门介绍;另一方面相关分析软件层出不穷,如何选择合适的软件也成为数据分析中的关键问题。
今天分享一篇综述——临床肿瘤中全外显子组测序数据的分析工具,包含数据比对、SNV/InDel/CNV/MSI/HRD/TumorHeterogeneity等。
这篇文章逻辑清晰、通俗易懂,适合WES数据分析入门。
Figure1.Fromtissuetodata—stepsofwholeexomesequencing.Tissuepreprocessingstartswiththeidentificationoftumorregionsbyanexperiencedpathologist,followedbyDNAextraction,libraryconstruction,andamplification.Dataprocession
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