医院生物样本库建立与发展中文

生物样本库BS小组

原文刊发于《中国肿瘤》年第24卷第4期,经作者授权转载。

摘要:

肿瘤样本作为肿瘤基础研究与临床研究的宝贵资源,是肿瘤转化研究的基石。医院生物样本库于年建立,现已拥有多平方米独立场地,包括样本处理,储存,质控和技术平台等功能区,样本库信息系统采用实验室信息管理系统(LIMS)进行管理。同时努力推动浙江省共享平台发展,牵头成立了中国医药生物技术协会组织生物样本库分会浙江协作组。

关键词:生物样本库;共享平台;医院

肿瘤基础研究的巨大进步使我们对肿瘤的发病机制有了更为深刻的认识,但并没有迅速地给我们带来诊断、治疗和预防的新技术和新方法,主要是由于临床人员和基础科学家之间没有建立起真正的交流与合作,也没有真正理解转化医学应从实际需求出发[1]。正因如此,各国政府都对肿瘤转化研究给予了高度重视。肿瘤样本作为肿瘤基础研究与临床研究的宝贵资源,是肿瘤转化研究的基石[2]。由此可见,一个高质量、高水准肿瘤生物样本库的建设是基因组、功能基因组、蛋白质组等生命科学研究与生物医药研发的最宝贵资源,也是众多重要基因、蛋白等科研成果快速产业化应用到临床诊断与疾病的预测、预防及个体化治疗的重要保证。已有事实表明,现代肿瘤研究是以规范化诊治的多中心临床队列建立为基础;以获得高质量肿瘤样本和系统临床随访资料为核心。这两项已成为国际生物医药领域竞争的决定性因素,也是转化医学研究的基础。

1医院生物样本库建立与发展

年,医院生物样本库由浙江省卫生厅拨款万,医院配套万,在美国耶鲁大学肿瘤中心的指导下,参照美国国立肿瘤研究院[NCIBestPracticesforBiospecimenResources()]的建设要求,以资源共享,提高资源利用率为出发点,建立了规范的肿瘤病例信息平台和肿瘤标本资源库。年7月医院成立样本库管理中心,院长毛伟敏教授任中心学术委员会主任,书记袁瑞玉任伦理委员会主任,副院长葛明华教授任中心主任,病理科主任孙文勇任常务副主任,肿瘤研究所凌志强任中心副主任,全面负责肿瘤生物样本库的各项日常工作。

至今,样本库工作人员共有15人(专职人员7人)。几年来,完善了生物样本库SOP文件;制定医院生物样本库中长期规划;完善生物样本库样本入库,使用申请和收费等规定;建立生物样本库院内网页,实现了样本入库和使用申请的网络化管理等;严格执行取样前知情同意书签订工作;不断完善样本库入库患者随访工作;独立开发完成《物联网肿瘤标本库管理信息系统》;建设浙江省癌症中心肿瘤生物样本库信息网等工作。

我院样本库建设也受到省卫计委和中国医药生物技术组织生物样本库分会的重视和关心,年获得卫生事业专项补助资金“浙江省组织生物样本库创新服务平台建设助”(2208)万;葛明华副院长入选“全国生物样本标准化技术委员会”。

2医院新生物样本库整体建设

医院致力于建设科研型生物样本库,基于循证医学的标准化SOP流程[3],重视样本,捐献者信息,标准化技术平台和数据挖掘等一体化发展。医院生物样本库远期规划,今后样本库总面积达到m2以上,建设能满足6万例患者(多万份)样本储存的动态库。其中Ⅰ期建设平方米以上,主要功能区包括样本前处理与信息管理区,液氮区,冰箱区,质量控制室,原位杂交实验室,原代细胞培养室,洗涤室和办公区等。新样本库场地建设已于年12月底完成。同时,新样本库信息化基于实验室信息管理系统(LIMS)进行管理和运行,于年12月中旬开始实施,该项目完成后,将搭建样本库共享平台,完善样本和患者信息管理,加强质控信息管理,整合各项流程管理,汇总标准化技术平台产生的衍生数据,为大数据背景下的资源库建设奠定基础。

另外,完善样本类别,加强同一患者样本序贯收集[4],优化样本采集、保存流程[5],







































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