纯生信分析挖掘肿瘤突变负荷与免疫浸润的关

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//01研究背景//缩写：TMB：肿瘤突变负荷（tumormutationburden）BLCA：膀胱癌（bladdercancer）OS：整体生存（overallsurvival）DFS：无病生存期（Disease-freesurvival）膀胱癌是指发生在膀胱黏膜上的恶性肿瘤。是泌尿系统最常见的恶性肿瘤，也是全身十大常见肿瘤之一。近年来，免疫治疗在膀胱癌中取得了巨大的进展。TMB可以作为预测免疫治疗效果的一种生物标志物，TMB就是肿瘤组织每兆碱基中突变的总数，通俗的讲，就是肿瘤基因的突变密度。一般来说，TMB水平高的肿瘤，代表着肿瘤细胞中能被免疫系统识别的越多。Zhang等人结合TCGA数据库中膀胱癌的体细胞突变数据计算病人的TMB值，基于该值的中位数值将样本划分为高TMB组合低TMB组，首先刻画高低TMB组生存的差异；接下来，结合膀胱癌病人的表达谱数据，识别高低TMB组差异的基因，使用单因素和多因素cox回归分析进而结合构建了由8个基因组成的膀胱癌预后模型；考虑到TMB值和免疫治疗的关系，使用CIBERSORT软件对膀胱癌病人中种免疫细胞的组成刻画，基于单因素cox回归分析，找到潜在影响病人生存的免疫细胞类。今天就和大家分享一篇相关研究的文章杂志：JournalOfCellularPhysiologyIF：4.55发表时间：.9.7//0主要方法和材料//1.训练数据：TCGA数据库中膀胱癌病人的突变、表达谱以及临床数据（如Table1）所示。.验证数据集：从cBioportal(

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